Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms