Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms