Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRAMD4Q6IC98 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms