Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms