Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWISTNBQ3B726 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms