Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SGSM1Q2NKQ1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SGSM1Q2NKQ1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SGSM1Q2NKQ1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGSM1Q2NKQ1 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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