Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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