Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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