Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
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GRIK5Q16478 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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GRIK5Q16478 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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GRIK5Q16478 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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GRIK5Q16478 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK5Q16478 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
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