Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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SSX1Q16384 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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SSX1Q16384 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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SSX1Q16384 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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SSX1Q16384 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SSX1Q16384 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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SSX1Q16384 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSX1Q16384 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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