Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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