Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AL590491.2-202ENST00000611126 418 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC032044.1-201ENST00000570924 570 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms