Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms