Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 MIR583HG-201ENST00000507997 704 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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