Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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