Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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COL4A6Q14031 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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COL4A6Q14031 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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COL4A6Q14031 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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COL4A6Q14031 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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COL4A6Q14031 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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COL4A6Q14031 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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COL4A6Q14031 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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COL4A6Q14031 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
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COL4A6Q14031 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
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COL4A6Q14031 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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COL4A6Q14031 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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