Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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