Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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