Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187 ms