Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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