Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AL359641.1-201ENST00000412509 1558 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 BACE2-IT1-201ENST00000433378 382 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 RPL22L1-202ENST00000463836 506 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 NFRKB-205ENST00000526940 539 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC243972.2-201ENST00000541653 991 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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MKRN4PQ13434 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 LINC01198-206ENST00000595532 1125 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC242988.1-201ENST00000611044 714 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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