Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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PDE3BQ13370 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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