Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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