Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.293e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.263e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.183e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.796e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 PWP1-201ENST00000412830 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.336e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 C14orf2-207ENST00000554528 526 ntTSL 29.89□□□□□ -0.833e-11■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CSDE1-207ENST00000483407 741 ntTSL 27.22□□□□□ -1.255e-35■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 NT5DC2-206ENST00000466112 887 ntTSL 220.68■□□□□ 0.92e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RPL12-202ENST00000483598 344 ntTSL 25.49□□□□□ -1.531e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.523e-39■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.023e-39■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 PRDX1-203ENST00000372079 609 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.113e-39■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ANAPC11-220ENST00000584197 386 ntTSL 531.37■■■□□ 2.612e-16■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 UROS-205ENST00000420761 802 ntTSL 531.33■■■□□ 2.611e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CERS2-206ENST00000421609 738 ntTSL 331.14■■■□□ 2.581e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.41e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 D2HGDH-214ENST00000473126 1612 ntTSL 1 (best)28.3■■■□□ 2.121e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SREBF1-214ENST00000486311 473 ntTSL 327.34■■□□□ 1.971e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ATP5A1-205ENST00000586592 2214 ntTSL 225.82■■□□□ 1.724e-26■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 BSCL2-211ENST00000448568 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 325.81■■□□□ 1.726e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.72e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.692e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 D2HGDH-215ENST00000486953 2232 ntTSL 1 (best)25.48■■□□□ 1.671e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 PGLS-206ENST00000600923 651 ntTSL 325.33■■□□□ 1.651e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.634e-26■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.611e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 C11orf24-207ENST00000532534 687 ntTSL 325.11■■□□□ 1.612e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.571e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 D2HGDH-202ENST00000400769 2277 ntTSL 224.86■■□□□ 1.571e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 D2HGDH-212ENST00000468064 2298 ntTSL 1 (best)24.86■■□□□ 1.571e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ETFA-206ENST00000559075 1735 ntTSL 224.52■■□□□ 1.523e-12■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 PGLS-202ENST00000594761 880 ntTSL 524.2■■□□□ 1.461e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RILP-204ENST00000574810 978 ntTSL 324.16■■□□□ 1.462e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.421e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.411e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.411e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.381e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 COG8-202ENST00000562595 2262 ntTSL 523.59■■□□□ 1.371e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 LRCH4-204ENST00000476881 1675 ntTSL 223.57■■□□□ 1.361e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ATG101-203ENST00000548915 658 ntTSL 323.51■■□□□ 1.356e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ATG101-204ENST00000550604 671 ntTSL 323.14■■□□□ 1.296e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.292e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.251e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.231e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.226e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 PHF1-209ENST00000487667 1930 ntTSL 522.67■■□□□ 1.221e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.221e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.211e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SREBF1-212ENST00000478616 882 ntTSL 522.51■■□□□ 1.191e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.191e-31■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.191e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 FAM50A-201ENST00000158526 1240 ntTSL 522.41■■□□□ 1.186e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.162e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ETFA-211ENST00000560044 1054 ntTSL 522.29■■□□□ 1.163e-12■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 OGFOD2-223ENST00000545396 1341 ntTSL 522.24■■□□□ 1.156e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.126e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 LRCH4-205ENST00000485554 774 ntTSL 321.81■■□□□ 1.081e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.081e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.051e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 11e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 LRR1-204ENST00000554869 1886 ntTSL 1 (best)21.27■■□□□ 11e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.976e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.976e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.961e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.961e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RILP-202ENST00000570858 1131 ntTSL 221.02■□□□□ 0.962e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.946e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 OGFOD2-213ENST00000540324 1828 ntTSL 1 (best)20.86■□□□□ 0.936e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 C11orf24-205ENST00000530166 941 ntTSL 320.85■□□□□ 0.932e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ATG101-202ENST00000547409 759 ntTSL 320.84■□□□□ 0.936e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.91e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.91e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.891e-31■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.882e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.872e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ATG101-206ENST00000552947 1312 ntTSL 1 (best)20.5■□□□□ 0.876e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 YTHDF2-206ENST00000478283 2594 ntTSL 1 (best)20.48■□□□□ 0.873e-12■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 C11orf24-202ENST00000527280 533 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.47■□□□□ 0.872e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 JMJD6-204ENST00000542934 1898 ntTSL 220.47■□□□□ 0.871e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.861e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.861e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.841e-31■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.846e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.836e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.832e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.821e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.822e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.811e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.791e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ATG101-205ENST00000552544 837 ntTSL 219.97■□□□□ 0.796e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 JMJD6-201ENST00000303996 1893 ntTSL 219.95■□□□□ 0.781e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.761e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 C11orf24-204ENST00000529590 610 ntTSL 319.76■□□□□ 0.752e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 LONP1-211ENST00000590558 2884 ntTSL 519.56■□□□□ 0.721e-31■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CERS2-210ENST00000558062 896 ntTSL 219.47■□□□□ 0.711e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.76e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.691e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.681e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.682e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 D2HGDH-206ENST00000436747 4549 ntTSL 1 (best)19.2■□□□□ 0.661e-6■□□□□ 9.5
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