Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms