Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
GRIK2Q13002 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK2Q13002 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms