Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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