Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYCNQ0VAF6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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