Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSRP1Q08945 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms