Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSC1Q08554 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC1Q08554 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC1Q08554 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC1Q08554 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC1Q08554 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC1Q08554 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC1Q08554 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC1Q08554 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC1Q08554 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC1Q08554 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC1Q08554 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC1Q08554 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC1Q08554 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC1Q08554 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC1Q08554 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC1Q08554 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC1Q08554 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC1Q08554 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC1Q08554 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC1Q08554 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC1Q08554 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC1Q08554 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC1Q08554 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC1Q08554 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms