Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms