Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms