Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RELQ04864 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
RELQ04864 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RELQ04864 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RELQ04864 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RELQ04864 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RELQ04864 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RELQ04864 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
RELQ04864 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
RELQ04864 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
RELQ04864 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RELQ04864 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RELQ04864 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RELQ04864 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
RELQ04864 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
RELQ04864 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RELQ04864 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
RELQ04864 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RELQ04864 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms