Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN1Q04323 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN1Q04323 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms