Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms