Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms