Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms