Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms