Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF5P84085 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF5P84085 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF5P84085 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF5P84085 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF5P84085 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF5P84085 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF5P84085 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF5P84085 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms