Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms