Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HBBP68871 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
HBBP68871 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
HBBP68871 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
HBBP68871 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
HBBP68871 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
HBBP68871 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
HBBP68871 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HBBP68871 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HBBP68871 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
HBBP68871 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HBBP68871 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HBBP68871 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms