Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP46P62068 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP46P62068 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP46P62068 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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