Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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UBE2NP61088 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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UBE2NP61088 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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UBE2NP61088 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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UBE2NP61088 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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UBE2NP61088 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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UBE2NP61088 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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UBE2NP61088 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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UBE2NP61088 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2NP61088 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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