Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms