Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME5P56597 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME5P56597 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms