Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CASP9P55211 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CASP9P55211 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASP9P55211 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASP9P55211 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASP9P55211 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASP9P55211 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASP9P55211 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASP9P55211 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASP9P55211 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASP9P55211 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASP9P55211 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASP9P55211 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASP9P55211 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CASP9P55211 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASP9P55211 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASP9P55211 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CASP9P55211 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASP9P55211 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASP9P55211 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASP9P55211 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASP9P55211 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CASP9P55211 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CASP9P55211 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CASP9P55211 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CASP9P55211 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASP9P55211 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASP9P55211 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASP9P55211 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASP9P55211 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASP9P55211 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASP9P55211 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASP9P55211 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASP9P55211 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASP9P55211 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASP9P55211 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASP9P55211 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASP9P55211 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASP9P55211 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASP9P55211 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASP9P55211 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASP9P55211 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASP9P55211 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASP9P55211 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASP9P55211 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASP9P55211 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASP9P55211 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASP9P55211 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CASP9P55211 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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