Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB3P54284 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms