Protein–RNA interactions for Protein: P53634

CTSC, Dipeptidyl peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSCP53634 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSCP53634 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSCP53634 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSCP53634 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSCP53634 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSCP53634 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSCP53634 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSCP53634 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSCP53634 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSCP53634 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTSCP53634 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSCP53634 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSCP53634 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSCP53634 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms