Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KPNA1P52294 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KPNA1P52294 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms