Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF6P49848 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF6P49848 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF6P49848 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF6P49848 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF6P49848 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF6P49848 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF6P49848 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF6P49848 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF6P49848 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF6P49848 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF6P49848 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF6P49848 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms